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小米手机短信图标消失可能有以下几种原因。
1、可能在桌面的设置中将短信应用隐藏或移除出了桌面，可以进入设置中的“应用管理”或“应用列表”，查看短信应用是否被隐藏或停用，如果找到了短信应用，可以根据需要进行恢复或启用。
2、可能误删了短信应用的相关文件或数据，导致应用无法正常运行，这种情况下可以尝试从应用商店重新下载并安装短信应用，在安装过程中，手机可能会自动恢复原有的数据和应用设置，如果无法恢复，可能需要联系小米客服进行数据恢复。
3、手机系统出现了问题，导致短信图标消失，可以尝试重启手机或者进行系统重置来解决这个问题，但请注意，系统重置会清除手机上的所有数据，所以在操作之前请确保备份重要数据。
如果以上方法都无法解决问题，建议联系小米的官方客服或者到小米的维修点进行检修，以获取专业的帮助。